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根据种类的不同，各种农药残留分析的技术手段也不尽相同。色谱检测法是一种农残定量分析的方法，为农残在市场上的流通提供了依据。包括气相色谱、液相色谱、气质联用等。
GC（气相色谱）采用气体做流动相，可以用于挥发性农药的检测，是农药残留检测非常常用的方法，有灵敏度高、分离效能高、选择性高、分析速度快以及应用范围广等特点；HPLC（液相色谱）检测分析高沸点和热不稳定的农药残留分析是农药残留定性、定量分析的有效手段。弥补了气相色谱技术的缺陷，可以对甲酸酯类农药灭蝇胺、及有机氯元素等进行残留检测。
GC-MS（气相色谱-质谱联用仪器）将气相色谱仪和质谱仪串联起来，可以对多种农药进行结构确认，对多残留农药进行更为准确、灵敏的定量分析。LC/MS（液相色谱-质谱连用法）集LC的高分离能力与MS的高灵敏度、高选择性于一体，也是农药残留分析中很有力的一种方法，采用前处理和LC/MS/MS检测方法，单针可测定331种农药及其代谢物，共计三百七十余种农残组分。
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水果蔬菜检测
随着我国经济的快速发展和人民生活水平的提高，我国水果和蔬菜的产量与需求量有着极大的提高。在蔬菜和水果种植过程中，各种杀虫剂、除草剂等农药的使用以及土壤的重金属污染问题，对人们的身体健康存在重大的安全隐患。国家制定了多项食品安全标准来监督检查水果蔬菜中的农药残留及重金属残留的指标，从而保证人民群众的食品安全。
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